Recherche

Notre recherche dans le domaine des maladies infectieuses cliniques se concentre sur les aspects épidémiologiques et cliniques des infections à S. aureus et sur la colonisation par S. aureus. En réponse aux problèmes cliniques rencontrés dans le cadre du service de consultation, d'autres études visent à améliorer la gestion clinique des patients atteints de certaines maladies (par exemple, le dépistage de la tuberculose, les abcès amibiens, les infections dues à des agents pathogènes rares). En outre, nous développons actuellement notre programme d'intendance des antibiotiques.

Staphylocoque doré

• Étude rétrospective sur les aspects cliniques et microbiologiques des infections à S. aureusà l'hôpital universitaire de Bâle
• Épidémiologie et facteurs de risque de colonisation par S. aureus et SARM dans les populations à risque (par ex. consommateurs de drogues par voie intraveineuse, patients atteints de polyarthrite rhumatoïde)

Problèmes cliniques spécifiques liés au travail clinique

• Dépistage de la tuberculose et traitement des réfugiés présentant des infiltrats pulmonaires
• Diagnostic des abcès du foie amibien
• Valeur de la procalcitonine comme paramètre de diagnostic des infections après une intervention neurochirurgicale
• Peptide atrial natriurétique en cas de sepsis sévère et de choc septique

Intendance des antibiotiques

• Antibiothérapie empirique chez les patient(e)s admis(e)s par les urgences
• Participation à l'étude ARPAC (Antibiotic Resistance Prevention and Control) : étude européenne visant à déterminer la politique en matière d'antibiotiques, les modèles de prescription et les mesures de contrôle des infections associés à des taux plus faibles d'agents pathogènes résistants aux antibiotiques au niveau des différents hôpitaux.

Notre recherche en épidémiologie des infections se concentre sur les mécanismes de transmission des Clostridioides difficile et des bactéries à Gram négatif avec bêta-lactamase à large spectre (ESBL). La surveillance des infections du site opératoire est un autre axe important, notamment la recherche sur les infections à corps étranger. De nouvelles interventions en épidémiologie hospitalière ont été établies à l'Hôpital universitaire de Bâle en étroite collaboration avec le département de microbiologie clinique. Nous avons introduit avec succès de nouvelles méthodes de typage qui facilitent l'étude des voies de transmission. Pour C. difficile, nous sommes le laboratoire de référence suisse.

Infections fongiques

• FUNGINOS Fungal Infection Network of Switzerland : spécialistes de sept hôpitaux universitaires et de dix hôpitaux partenaires en Suisse, qui s'occupent de l'épidémiologie et de la gestion des infections fongiques.
• Aspergillose invasive chez les patients ayant subi une transplantation de moelle osseuse

Maladies infectieuses chez les patient(e)s transplanté(e)s

• Swiss Transplant Cohort Study (STCS) : étude prospective sur les complications post-transplantation chez les receveurs de greffes d'organes et de moelle osseuse/cellules souches, y compris une base de données prospective pour la surveillance des infections.

Virologie de la transplantation

• Virus BK, EBV, CMV : trois domaines de recherche sont actuellement poursuivis : Dans le domaine clinique, la définition des facteurs de risque et les stratégies d'intervention sont étudiées. Dans le domaine virologique, les modifications génotypiques du génome du virus BK (BKV) sont étudiées pour leurs conséquences fonctionnelles. Dans le domaine immunologique, la caractérisation de la réponse immunitaire humorale et cellulaire des patients transplantés rénaux est étudiée en tant que marqueur de substitution complémentaire qui, avec la charge virale BKV dans le plasma et l'urine, pourrait permettre de prédire la progression et la régression de la néphropathie associée au polyomavirus. Des approches similaires sont suivies en ce qui concerne le cytomégalovirus et le virus d'Epstein-Barr chez les patients ayant subi une transplantation rénale, cardiaque ou de cellules souches.

Une collaboration avec l'Institut Tropical et de Santé Publique Suisse (Swiss TPH) www.swisstph.ch

En collaboration avec des scientifiques d'organisations partenaires, nous menons des recherches épidémiologiques et cliniques dans le domaine des maladies chroniques dans différents pays d'Afrique subsaharienne. L'accent est mis sur le VIH/sida et la tuberculose. Cependant, les maladies chroniques non infectieuses telles que l'hypertension, le diabète et la santé mentale prennent de plus en plus d'importance dans notre recherche.

Nos projets associent la recherche à l'amélioration du traitement clinique dans les pays partenaires en Afrique et offrent des possibilités de formation et de carrière aux jeunes spécialistes en Afrique subsaharienne et en Suisse.

La recherche dans le domaine du VIH vise à réagir aux nouveaux développements. Nous menons des études sur des questions clinico-épidémiologiques telles que la récupération immunitaire sous traitement ainsi que des essais thérapeutiques prospectifs. En outre, nous visons à améliorer la sécurité et l'utilisation de la thérapie antirétrovirale en étudiant les questions de toxicité et d'interactions médicamenteuses, et en définissant le moment optimal pour commencer le traitement. La clinique VIH de Bâle est l'un des centres de l'étude suisse de cohorte VIH et de nombreuses études sont menées dans le cadre de cette étude observationnelle, prospective et multicentrique.

• Description de l'évolution clinique avec et sans traitement (évolution des cellules CD4-T, projets concernant le meilleur choix de traitement pour des groupes de patients spécifiques).
• Études prospectives de phase II et III.
• Études dans le domaine médico-social et économique.
• Études pathophysiologiques en collaboration avec l'Institut de microbiologie médicale de Bâle et d'autres groupes suisses dans le cadre de l'Étude suisse de cohorte VIH.

Aptitude des patients à commencer un TAR (projet READY)

• Nous étudions l'aptitude des patients à suivre un traitement contre le VIH et visons à développer des outils d'enseignement pour améliorer la qualité de la communication des prestataires de soins de santé.

Interactions médicament-drogue

• Les interactions médicamenteuses potentiellement pertinentes d'un point de vue clinique sont devenues un problème majeur dans le traitement du VIH en raison du vieillissement des patients infectés par le VIH et de la prévalence accrue des co-médicaments. Nous visons à étudier les interactions médicamenteuses qui sont difficiles pour le traitement du VIH.

Toxicité

• Les événements indésirables liés aux traitements antirétroviraux combinés sont des raisons fréquentes de modification du traitement et de mauvaise adhérence. Nous avons étudié les prédicteurs de la modification du traitement dans le cadre de la Swiss HIV Cohort Study. Bien que la toxicité reste une raison fréquente de changement de traitement, peut-être en raison de la large disponibilité d'autres médicaments antirétroviraux, elle n'altère pas le succès du traitement. La surveillance étroite et la gestion des effets secondaires et des interactions médicament-médicament sont essentielles pour la durabilité des cART.

Depuis 1988, l'Etude suisse de cohorte VIH est au service des personnes vivant avec le VIH et le sida et a accompagné plus de 19'000 personnes au cours de cette période. Elle s'engage à assurer une prise en charge optimale des patientes et des patients ainsi qu'une excellente activité de recherche.

Plus d'informations

Chez les patients souffrant d'une déficience immunitaire, par exemple chez les personnes âgées, après une transplantation d'organes ou de cellules souches ou en cas d'infection par le VIH, les infections par des virus, des bactéries et des champignons entraînent souvent des complications dangereuses et parfois même la mort. Dans ce cas, l'interaction entre l'immunité innée et l'immunité acquise est déséquilibrée et le contrôle des agents infectieux est insuffisant.

Le groupe de recherche "Infection Biology" est dirigé par le professeur Nina Khanna. Nous étudions l'interaction complexe du système immunitaire avec différents agents pathogènes chez les patients immunodéprimés.

Notre principal objectif :

1. Contrôle immunologique des infections fongiques
2. Infections associées à des corps étrangers
3. Développement d'adjuvants pour l'amélioration des vaccins.

1) Les infections fongiques invasives causées par Aspergillus fumigatus et Candida albicans sont des complications infectieuses fréquentes. Elles touchent en particulier les patients souffrant de neutropénie et de lymphopénie sévères et prolongées suite à des leucémies, après une transplantation allogénique de cellules souches ainsi qu'une infection VIH avancée. Des thérapies préemptives ou, plus récemment, des thérapies prophylactiques sont souvent utilisées. L'utilisation de ces modalités thérapeutiques est problématique, car d'une part, des infections de rupture et des infections dues à des agents pathogènes résistants peuvent survenir. D'autres problèmes sont les effets secondaires, les interactions médicamenteuses et le coût élevé des médicaments.

Notre objectif est d'identifier précocement les patients à risque d'infections fongiques invasives et de développer des stratégies immunothérapeutiques, telles que la vaccination ou le transfert adoptif de cellules T.

2) Les implants tels que les prothèses orthopédiques sont de plus en plus utilisés en médecine en raison du vieillissement de la population. Environ 1 à 2 % des implants provoquent des infections après l'opération. Les infections à Staphylococcus aureus associées aux corps étrangers sont associées à une morbidité significative et à des coûts élevés. En raison de la formation d'un biofilm, ces infections sont très difficiles à traiter. C'est pourquoi notre groupe de recherche étudie de nouvelles stratégies thérapeutiques, telles que de nouvelles substances antimicrobiennes et des revêtements de surface, en collaboration avec différentes universités et entreprises.

Notre objectif est de caractériser de nouvelles substances antimicrobiennes ainsi que leur activité contre les biofilms et d'expliquer leur mécanisme d'action.

3) La réponse d'une personne à une vaccination dépend du fonctionnement de son système immunitaire. Le système immunitaire inné est très important pour la mise en place d'une réponse immunitaire acquise qui protège contre les virus et les bactéries par la production d'anticorps, par exemple. Cette interaction entre l'immunité innée et l'immunité acquise joue un rôle important dans les infections "naturelles", mais aussi dans la vaccination. Des mutations génétiques dans le système immunitaire inné peuvent donc entraîner une moins bonne ou une meilleure efficacité de la vaccination.
Nous étudions comment certains messagers du système immunitaire inné influencent la réaction à la vaccination. Nous nous concentrons principalement sur une classe d'interférons récemment découverte - la famille de l'interféron lambda. L'interféron lambda a une forte influence sur les cellules B et les plasmocytes qui produisent des anticorps.

Notre objectif est d'étudier l'influence de l'interféron lambda et des mutations génétiques dans les gènes de l'interféron lambda lors de différentes infections et vaccinations. Cela devrait permettre de développer à l'avenir de nouveaux types d'adjuvants.