Virologie clinique

Les agents infectieux viraux, les anticorps spécifiques des virus, les antigènes, les génomes ou les cellules T sont détectés qualitativement ou quantitativement à partir des matériaux d'analyse les plus divers (sang, urine, selles, frottis, sécrétions, lavages, ponctions et tissus) afin de diagnostiquer l'infection, la réplication, l'immunité, le typage ou la résistance antivirale et, le cas échéant, la dynamique.

Nos demandes les plus fréquentes sont la détection quantitative du VIH dans le plasma, du cytomégalovirus dans le plasma, du virus Epstein-Barr dans le sang total EDTA, du virus de l'hépatite B dans le plasma, du virus de l'hépatite C dans le plasma et du polyomavirus BK dans le plasma.

Pour la plupart des infections virales, nous proposons les examens de sérologie infectieuse correspondants, qui peuvent être réalisés initialement en cas de suspicion ou de dépistage ou au cours de l'évolution ou du suivi.

Pour les examens individuels urgents de notre offre de base ou pour des questions spéciales, il est utile de contacter par téléphone le responsable spécialisé de garde afin de déterminer le déroulement et la priorité.

Nos demandes les plus fréquentes sont la détection quantitative du VIH dans le plasma, du cytomégalovirus dans le plasma, du virus Epstein-Barr dans le sang total EDTA, du virus de l'hépatite B dans le plasma, du virus de l'hépatite C dans le plasma et du polyomavirus BK dans le plasma.

Différents matériels d'examen peuvent être analysés en fonction de la question clinique, de l'épidémiologie et des manifestations (groupe à risque VIH, transplantation, immunodéprimé, voyageur de retour, systémique ou localisé, respiratoire, gastro-intestinal, neurologique, cutané, génital).

En ce qui concerne le diagnostic différentiel, le matériel d'analyse, le prélèvement et le transport, des informations sont disponibles dans le répertoire des analyses ou peuvent être discutées avec l'équipe de virologie clinique.

Nous proposons des génotypages et des tests de résistance pour les virus suivants :

• Génotypage du VIH-1 (groupe M sous-types A-K et CRFs, groupe O) et interprétation de la résistance selon Stanford pour la protéase, la transcriptase inverse et l'intégrase.
• Tropisme du VIH-1 (CCR5/CXCR4) et génotype du patient CCR5 / CCR5D32
• Test de résistance au cytomégalovirus (UL97 sérine/thréonine kinase et UL54 ADN polymérase et UL56 terminase complex)
• Virus de l'herpès simplex 1/-2 Test de résistance (UL23 thymidine kinase et UL30 ADN polymérase)
• Test de résistance au virus de l'hépatite B (génotype A-J ; ADN polymérase virale <s>pol </s>)
• Génotypage du virus de l'hépatite E (génotype 1-4)
• Génotypage des entérovirus (génotype A-C)
• JC Polyomavirus Génotypage (génotype 1-8, réarrangements NCCR)
• BK Polyomavirus Génotypage (génotype 1-4, réarrangements NCCR)

En ce qui concerne le diagnostic différentiel, le matériel d'analyse, le prélèvement et le transport, vous trouverez des informations dans le répertoire des analyses ou vous pouvez également en discuter avec l'équipe de virologie clinique...

Nos demandes les plus fréquentes sont la détection du cytomégalovirus et du virus de l'herpès simplex 1/-2 dans le lavage broncho-alvéolaire, du virus de l'herpès simplex 1/-2 dans les frottis ou le contenu des vésicules et du virus varicelle-zona dans les frottis ou le contenu des vésicules. En outre, nous proposons une détermination phénotypique en temps réel de la résistance des isolats d'Herpes simplex Virus-1/-2 à l'aciclovir.

En tant que centre national de l'OMS pour la poliomyélite, nous recevons des échantillons de selles de médecins de toute la Suisse pour la recherche de poliovirus. Il est important que deux échantillons soient prélevés à 24 ou 48 heures d'intervalle, car les poliovirus peuvent être excrétés de manière intermittente (lien vers le formulaire de demande | Formulaire d'envoi).

Différents matériaux d'analyse peuvent être analysés en fonction de la question clinique, de l'épidémiologie et des manifestations (respiratoires, cutanées, génitales).

En ce qui concerne le diagnostic différentiel, le matériel d'analyse, le prélèvement et le transport, des informations sont disponibles dans le répertoire des analyses ou peuvent être discutées avec l'équipe de virologie clinique.

En collaboration avec le département de chimie clinique, nous proposons actuellement quotidiennement les détections d'anticorps et d'antigènes suivantes :

• Cytomegalievirus (CMV) anticorps IgG et IgM, avidité IgG
• Virus d'Epstein-Barr (EBV) EBNA-1 IgG, VCA IgG, VCA IgM
• Anticorps totaux et IgM de l'hépatite A
• Virus de l'hépatite B
  • Antigène HBs
  • Antigène HBe
  • Anticorps HBe
  • Anticorps HBs quantitatifs
  • Anticorps HBc total et IgM
• Virus de l'hépatite C
  • Anticorps de l'hépatite C
• Virus de l'hépatite D
  • Anticorps IgG et/ou IgM
• Test de dépistage du VIH (test de 4e génération avec antigène p24 et anticorps IgG et IgM du VIH-1, du VIH-2)
• immunoblot VIH-1
• Anticorps au virus de l'herpès simplex (HSV)-1/-2 total et IgM, et anticorps spécifiques au HSV-2 (IgG)
• Anticorps IgG et/ou IgM de la rougeole
• Oreillons Anticorps IgG et/ou IgM
• Anticorps anti-Rubella IgG et/ou IgM
• Anticorps IgG et/ou IgM au parvovirus B19
• Virus varicelle-zona (VZV) IgG et/ou IgM anticorps
• Virus de l'encéphalite à tiques (anticorps IgG et/ou IgM, anticorps intrathécaux IgG)
• Virus chez les personnes de retour des tropiques, y compris dengue, chikungunya, zika, fièvre jaune, Japon. Encéphalite, panel de flavirus (IgG et/ou IgM)